同时，朱棣还进一步抬高了文官的地位以制衡武官。
从明朝中期开始，文官集团越来越强大，而且和宋朝不同的是，文官中还出现了不少非常优秀的军事指挥人才，因此武官的地位愈加被边缘化。
而武官想要做大事就必须跪舔文官，像名将戚继光之所以能够成功扫荡倭寇，名垂青史，正是因为背后有了文官胡宗宪、张居正、谭纶等人的鼎力支持。
朱由校想了许久说道“兵部以后会增加或减少一些职能，而五军都督府之上设立大元帅府，同时增设海外都督府用来管理驻守海外的军队，而新增的济州岛、郁陵岛归海外军事部管辖，至于这大元帅则由朕担任。”
“同时关于军械制造等军事职责从工部脱离出来，改设为军械制造局和军械研发局，归大元帅府管辖，以后大元帅府跟内阁互不统属，实现军政分离！”
难怪皇上御驾亲征后自称大元帅，原来是早走预谋！
众多大臣脸色非常难看，皇上又要抬高武将地位，要让这些粗鄙武夫重新站在我等读书人头上耀武扬威吗？
施凤来脸色铁青，直接大声说道“皇上，此事万万不可，武将乃乱国根源……”
“够了，再敢胡言乱语给朕叉出去！”朱由校冷冷的吼道！
“不要以为朕不知道你是怎么想的，以文制武是不是让你感觉很爽？”
施凤来黑着脸顶道“老臣不敢！”
“还狡辩，在座的的诸位有几人想过如何提高大明军队的战斗力？”
众臣沉默不语，无人敢答话，以免引火烧身！
“朕听说大明出现这么一种怪像，五品的卫所千户居然要先向七品知县行礼，朕现在都搞不清楚到底是五品大还是七品大，你们说呢？”
皇上你怎么能这么说呢？这些粗鄙武夫讨好文官，还不是伸手要钱粮？要军械？
孙承宗出来施礼道“皇上所言甚是，如果不及时扭转这一现象，确实会酿成大锅，老臣支持皇上对军事的改革！”
周延儒附和道“臣附议！”
两大巨头都站出来同意皇上的改革，剩下的众臣陆陆续续的出来附和！
朱由校看着杵在原地，脸色铁青的施凤来，冷冷的说道“施阁老打算坚持己见吗？”
施凤来脸色一会青一会白，皇上你怎么能以势压人？结结巴巴的回道“老臣，老臣附议！”
既然都表态同意了，以后如果敢拖朕的后腿，就别怪朕不客气了。
朱由校笑道“此事朕以后会做出具体的方案出来，希望诸位爱卿能像今天这样鼎力支持！”
众人纷纷施礼道“臣定会鼎力支持皇上的改革措施！”
希望能像你们口中所说的，朱由校沉吟了一会，开口说道“朕再次说一次，以后对朕提出的措施有不同意见的，可以拿出事实依据出来反驳，再敢拿什么子虚乌有的事情出来反驳，到时别怪朕不讲情面！”
朱由校说完怒气冲冲的站起来甩了甩衣袖，边走边说道“都散了！”
“臣等恭送皇上！”